相同点：不管是计算机软件专利还是软件著作权，两者都属于知识产权所能够保护的范畴。申请成功后都能拿到政府相应的资助。

不同点：

1、法律依据不同

软件的著作权保护依据《著作权法》和《计算机软件保护条例》。

软件的专利保护参照《专利法》，具体审查标准参见国家知识产权局专利《审查指南》第二部分第九章“涉及计算机程序的发明专利申请审查若干问题”。

2、保护客体不同

软件著作权申请提交的资料是源代码及用户操作手册，因此软件著作权保护的是软件的表现形式，而不保护思想。当然这样的话也就有可能出现竞争对手把你的软件分析研究，然后换一种编程语言，达到一样的效果，但由于代码是不同的，因此这种做法也不侵犯著作权。

而软件专利则不同，在申请时需要描述清楚的是软件的设计构思（注意一定要以技术方案的形式表现，最好能够结合硬件来表现），包含了软件流程图，而不是讲述用哪个程序语言来实现的。一旦获权后，他人只要采用了软件专利的设计构思或方案，就可能构成侵权。

3、保护原则不同

软件著作权是在软件创作完成后自动产生的，也是用户自愿进行软件著作权登记，主要用于声明著作权权属，登记的目的是体现公证的效力，同时也是后续维权时的有力证据。

软件专利则必须向专利局提出申请才能获得保护，因此必须要积极申请，且专利制度也是以“用公开换保护”为原则。

4、维护费用和保护期限不同

自然人的软件著作权，保护期为自然人终生及其死亡后50年；软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。法人或者其他组织的软件著作权，保护期为软件首次发表之后50年，但软件自开发完成之日起50年内未发表的，不再保护。

费用方面著作权只需要缴纳前期的申请费，后续不会有维护的费用。

一般来说软件专利只能申请发明专利，保护期限从申请日起算20年。发明专利每年都需要缴纳年费，过期不缴纳即视为放弃专利权。

5、各自的优势

软件著作权可以不用公开就受到保护，并且能够让创作者快速地获得著作权保护，普通登记一般4个月左右授权，采用加急申请软件著作权最快能一个工作日授权。能够让著作权人快速抢占市场，拿到政府相应的资助。